Структуру Восточноукраинской организации "Центр педагогических исследований" составляет Правление организации и Тематические секции, функция которых состоит в объединении студентов, аспирантов, молодых ученных и исследователей по их сферам научных интересов.

Основные тематические секции функционирующие в рамках Центра:

• Болонский процесс и образовательная система Украины (функционирует с марта 2009 года).
• Информационные технологии и образование (с декабря 2010 года).
• Инновации в образование (с ноября 2010 года).
• Современные методы и технологии преподавания (с апреля 2010 года).
• Психология человека (с июня 2009 года).
• Социальная и политическая социология (с июня 2009 года).

Рабочие заседание секций посещают как заинтересованные молодые исследователи проблем педагогики и психологии, так и те, кто уже сделал первые шаги в своих научных изысканиях. Расписание работы секций будет опубликовано на нашем сайте в скором времени.